中国科学院兰州化学物理研究所分离分析学科组建于1958年。近60年以来，在液相色谱、毛细管气相色谱、毛细管电泳、超临界流体色谱、质谱、气-质联用、液-质联用、核磁等研究领域做出了卓有成效的工作，在国内是该领域最早的、重要的、有影响的研究单位之一；在石油化工、油田分析、环境分析、植物化学等领域为国家经济建设作出了有显示度的贡献；曾获奖30余项，其中国家科技进步二等奖1项，中科院重大科技奖3项、科技进步奖一等奖2项、二等奖3项、三等奖1项，甘肃省技术发明奖一等奖1项，甘肃省科技进步一等奖1项、二等奖1项、三等奖1项，甘肃省自然科学二等奖1项、三等奖1项；五分之四以上论文发表在SCI收录的刊物上。分离分析学科是国家批准设立的博士和硕士研究生培养点，毕业研究生170余名，在读研究生40余名。从1984年以来，在西部药用植物化学方面作了大量卓有成效的研究工作，已承担中科院、国家基金委、国家973、甘肃省等多项重大项目。

   甘肃省天然药物重点实验室是在中国科学院兰州化学物理研究所分析化学和有机化学学科基础上，2002年7月经甘肃省人民政府批准成立了甘肃省天然药物重点实验室,是我国西部地区分离分析科学、天然药物化学，科学研究、技术发明、人才培养的重要基地之一。

   在甘肃省天然药物重点实验室科学研究、平台建设、人才培养、团队组织和学科积淀的基础上，进一步切实加强实验室科研体系建设，优化学科结构，建设优秀团队，全面提升实验室科技创新能力和发展后劲，服务西部区域经济社会可持续发展，2009年12月经中国科学院批准，成立中国科学院西北特色植物资源化学重点实验室。 

   建设“甘肃省省级工程研究中心”，符合中科院实施 “率先行动计划”的有关精神，符合中科院兰州化学物理研究所战略定位，符合研究室发展方向。鉴此，2014年09月经甘肃省发改委批准成立“甘肃省特色植物资源高值化利用工程研究中心”。

   为发展西北天然植物资源高值化产业的共性技术、关键技术、前沿技术的研究、工程化示范与快速转化、产业化，共同突破产业发展的技术瓶颈。形成产业技术创新链，培育产业重大技术及产品创新的产业集群。2014年12月经甘肃省发改委批准，成立“甘肃省中药提取分离技术行业技术中心”。 

   为进一步提升本领域区域创新能力建设水平，突破产业发展面临的瓶颈问题，进一步发挥对区域经济社会发展的影响和作用。 2015年12月经国家发改委批准，成立“特色药用植物资源高值化利用国家地方联合工程研究中心（甘肃）”。